Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RabggtaQ9JHK4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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