Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI7

Exosc9, Exosome complex component RRP45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc9Q9JHI7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Exosc9Q9JHI7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Exosc9Q9JHI7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Exosc9Q9JHI7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Exosc9Q9JHI7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Exosc9Q9JHI7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Exosc9Q9JHI7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Exosc9Q9JHI7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Exosc9Q9JHI7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Exosc9Q9JHI7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Exosc9Q9JHI7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Exosc9Q9JHI7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Exosc9Q9JHI7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Exosc9Q9JHI7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Exosc9Q9JHI7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Exosc9Q9JHI7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Exosc9Q9JHI7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Exosc9Q9JHI7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Exosc9Q9JHI7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Exosc9Q9JHI7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Exosc9Q9JHI7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Exosc9Q9JHI7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Exosc9Q9JHI7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Exosc9Q9JHI7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Exosc9Q9JHI7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Exosc9Q9JHI7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Exosc9Q9JHI7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Exosc9Q9JHI7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Exosc9Q9JHI7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Exosc9Q9JHI7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Exosc9Q9JHI7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Exosc9Q9JHI7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Exosc9Q9JHI7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Exosc9Q9JHI7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Exosc9Q9JHI7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Exosc9Q9JHI7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms