Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms