Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pgpep1Q9ESW8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pgpep1Q9ESW8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms