Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESU6

Brd4, Bromodomain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd4Q9ESU6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Brd4Q9ESU6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Brd4Q9ESU6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Brd4Q9ESU6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Brd4Q9ESU6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Brd4Q9ESU6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Brd4Q9ESU6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Brd4Q9ESU6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Brd4Q9ESU6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Brd4Q9ESU6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Brd4Q9ESU6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Brd4Q9ESU6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Brd4Q9ESU6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Brd4Q9ESU6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Brd4Q9ESU6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Brd4Q9ESU6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Brd4Q9ESU6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Brd4Q9ESU6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Brd4Q9ESU6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Brd4Q9ESU6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Brd4Q9ESU6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Brd4Q9ESU6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Brd4Q9ESU6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Brd4Q9ESU6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Brd4Q9ESU6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Brd4Q9ESU6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Brd4Q9ESU6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Brd4Q9ESU6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Brd4Q9ESU6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Brd4Q9ESU6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Brd4Q9ESU6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Brd4Q9ESU6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Brd4Q9ESU6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Brd4Q9ESU6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Brd4Q9ESU6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Brd4Q9ESU6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Brd4Q9ESU6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Brd4Q9ESU6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Brd4Q9ESU6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Brd4Q9ESU6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Brd4Q9ESU6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Brd4Q9ESU6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Brd4Q9ESU6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Brd4Q9ESU6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Brd4Q9ESU6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Brd4Q9ESU6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Brd4Q9ESU6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Brd4Q9ESU6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Brd4Q9ESU6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Brd4Q9ESU6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Brd4Q9ESU6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Brd4Q9ESU6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Brd4Q9ESU6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Brd4Q9ESU6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Brd4Q9ESU6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Brd4Q9ESU6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Brd4Q9ESU6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Brd4Q9ESU6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Brd4Q9ESU6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Brd4Q9ESU6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Brd4Q9ESU6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Brd4Q9ESU6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
Brd4Q9ESU6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Brd4Q9ESU6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Brd4Q9ESU6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Brd4Q9ESU6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Brd4Q9ESU6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Brd4Q9ESU6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Brd4Q9ESU6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Brd4Q9ESU6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Brd4Q9ESU6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Brd4Q9ESU6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Brd4Q9ESU6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Brd4Q9ESU6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Brd4Q9ESU6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Brd4Q9ESU6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Brd4Q9ESU6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Brd4Q9ESU6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Brd4Q9ESU6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Brd4Q9ESU6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Brd4Q9ESU6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Brd4Q9ESU6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Brd4Q9ESU6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Brd4Q9ESU6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Brd4Q9ESU6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Brd4Q9ESU6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Brd4Q9ESU6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Brd4Q9ESU6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Brd4Q9ESU6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Brd4Q9ESU6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Brd4Q9ESU6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Brd4Q9ESU6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Brd4Q9ESU6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
Brd4Q9ESU6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Brd4Q9ESU6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
Brd4Q9ESU6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Brd4Q9ESU6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Brd4Q9ESU6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Brd4Q9ESU6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Brd4Q9ESU6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms