Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESM3

Hapln2, Hyaluronan and proteoglycan link protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hapln2Q9ESM3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hapln2Q9ESM3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hapln2Q9ESM3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hapln2Q9ESM3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hapln2Q9ESM3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hapln2Q9ESM3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hapln2Q9ESM3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hapln2Q9ESM3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hapln2Q9ESM3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hapln2Q9ESM3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hapln2Q9ESM3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hapln2Q9ESM3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hapln2Q9ESM3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hapln2Q9ESM3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hapln2Q9ESM3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hapln2Q9ESM3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hapln2Q9ESM3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hapln2Q9ESM3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hapln2Q9ESM3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hapln2Q9ESM3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hapln2Q9ESM3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hapln2Q9ESM3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hapln2Q9ESM3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hapln2Q9ESM3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hapln2Q9ESM3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hapln2Q9ESM3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hapln2Q9ESM3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hapln2Q9ESM3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hapln2Q9ESM3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hapln2Q9ESM3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hapln2Q9ESM3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hapln2Q9ESM3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hapln2Q9ESM3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hapln2Q9ESM3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hapln2Q9ESM3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hapln2Q9ESM3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hapln2Q9ESM3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms