Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube3bQ9ES34 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms