Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tfip11Q9ERA6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms