Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms