Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQW4

Cyp3a44, Cytochrome P450, CYP3A, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a44Q9EQW4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp3a44Q9EQW4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms