Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndst3Q9EQH7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndst3Q9EQH7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms