Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ropn1lQ9EQ00 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ropn1lQ9EQ00 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ropn1lQ9EQ00 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ropn1lQ9EQ00 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ropn1lQ9EQ00 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ropn1lQ9EQ00 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ropn1lQ9EQ00 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ropn1lQ9EQ00 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ropn1lQ9EQ00 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ropn1lQ9EQ00 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ropn1lQ9EQ00 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ropn1lQ9EQ00 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ropn1lQ9EQ00 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ropn1lQ9EQ00 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ropn1lQ9EQ00 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ropn1lQ9EQ00 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ropn1lQ9EQ00 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ropn1lQ9EQ00 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ropn1lQ9EQ00 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ropn1lQ9EQ00 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ropn1lQ9EQ00 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ropn1lQ9EQ00 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ropn1lQ9EQ00 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ropn1lQ9EQ00 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ropn1lQ9EQ00 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ropn1lQ9EQ00 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ropn1lQ9EQ00 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ropn1lQ9EQ00 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ropn1lQ9EQ00 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ropn1lQ9EQ00 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ropn1lQ9EQ00 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ropn1lQ9EQ00 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ropn1lQ9EQ00 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms