Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rpgrip1Q9EPQ2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms