Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms