Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC69

Ndufa9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ndufa9Q9DC69 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ndufa9Q9DC69 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ndufa9Q9DC69 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ndufa9Q9DC69 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ndufa9Q9DC69 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ndufa9Q9DC69 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufa9Q9DC69 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms