Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms