Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB50

Ap1s2, AP-1 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s2Q9DB50 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s2Q9DB50 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms