Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med27Q9DB40 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms