Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL3

Ccdc54, Coiled-coil domain-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc54Q9DAL3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc54Q9DAL3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms