Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms