Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA39

Tmbim4, Protein lifeguard 4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmbim4Q9DA39 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms