Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34b2Q9D9N2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34b2Q9D9N2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34b2Q9D9N2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34b2Q9D9N2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34b2Q9D9N2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34b2Q9D9N2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34b2Q9D9N2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34b2Q9D9N2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34b2Q9D9N2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34b2Q9D9N2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34b2Q9D9N2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34b2Q9D9N2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34b2Q9D9N2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34b2Q9D9N2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34b2Q9D9N2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34b2Q9D9N2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34b2Q9D9N2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34b2Q9D9N2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34b2Q9D9N2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34b2Q9D9N2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34b2Q9D9N2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn34b2Q9D9N2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms