Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q9D9H8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q9D9H8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q9D9H8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q9D9H8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q9D9H8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Q9D9H8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q9D9H8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q9D9H8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q9D9H8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q9D9H8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q9D9H8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q9D9H8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q9D9H8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q9D9H8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q9D9H8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q9D9H8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q9D9H8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q9D9H8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q9D9H8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q9D9H8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Q9D9H8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Q9D9H8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q9D9H8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q9D9H8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q9D9H8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q9D9H8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q9D9H8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q9D9H8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms