Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9D8Q6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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