Protein–RNA interactions for Protein: Q9D869

Chp2, Calcineurin B homologous protein 2, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chp2Q9D869 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chp2Q9D869 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chp2Q9D869 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chp2Q9D869 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Chp2Q9D869 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chp2Q9D869 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Chp2Q9D869 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chp2Q9D869 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chp2Q9D869 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chp2Q9D869 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chp2Q9D869 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chp2Q9D869 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chp2Q9D869 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chp2Q9D869 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chp2Q9D869 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chp2Q9D869 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chp2Q9D869 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chp2Q9D869 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chp2Q9D869 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms