Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Capn9Q9D805 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
Capn9Q9D805 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Capn9Q9D805 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Capn9Q9D805 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Capn9Q9D805 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Capn9Q9D805 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Capn9Q9D805 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Capn9Q9D805 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Capn9Q9D805 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Capn9Q9D805 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Capn9Q9D805 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Capn9Q9D805 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Capn9Q9D805 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Capn9Q9D805 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms