Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7X1

Kctd4, BTB/POZ domain-containing protein KCTD4, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd4Q9D7X1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kctd4Q9D7X1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Kctd4Q9D7X1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kctd4Q9D7X1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kctd4Q9D7X1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kctd4Q9D7X1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kctd4Q9D7X1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kctd4Q9D7X1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kctd4Q9D7X1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kctd4Q9D7X1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kctd4Q9D7X1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kctd4Q9D7X1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kctd4Q9D7X1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kctd4Q9D7X1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Kctd4Q9D7X1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kctd4Q9D7X1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kctd4Q9D7X1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kctd4Q9D7X1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kctd4Q9D7X1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kctd4Q9D7X1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kctd4Q9D7X1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kctd4Q9D7X1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kctd4Q9D7X1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kctd4Q9D7X1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Kctd4Q9D7X1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kctd4Q9D7X1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kctd4Q9D7X1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kctd4Q9D7X1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kctd4Q9D7X1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kctd4Q9D7X1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kctd4Q9D7X1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kctd4Q9D7X1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms