Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7V1

Sh2d4a, SH2 domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d4aQ9D7V1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh2d4aQ9D7V1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sh2d4aQ9D7V1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sh2d4aQ9D7V1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sh2d4aQ9D7V1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sh2d4aQ9D7V1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms