Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmigd1Q9D7L8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms