Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf13Q9D777 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf13Q9D777 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf13Q9D777 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf13Q9D777 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf13Q9D777 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf13Q9D777 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf13Q9D777 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf13Q9D777 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf13Q9D777 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf13Q9D777 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf13Q9D777 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf13Q9D777 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf13Q9D777 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf13Q9D777 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf13Q9D777 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf13Q9D777 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf13Q9D777 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf13Q9D777 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf13Q9D777 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf13Q9D777 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf13Q9D777 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf13Q9D777 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf13Q9D777 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf13Q9D777 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf13Q9D777 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf13Q9D777 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf13Q9D777 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf13Q9D777 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf13Q9D777 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf13Q9D777 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf13Q9D777 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf13Q9D777 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf13Q9D777 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf13Q9D777 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf13Q9D777 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf13Q9D777 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf13Q9D777 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf13Q9D777 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf13Q9D777 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf13Q9D777 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf13Q9D777 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf13Q9D777 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf13Q9D777 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf13Q9D777 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf13Q9D777 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf13Q9D777 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf13Q9D777 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf13Q9D777 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf13Q9D777 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf13Q9D777 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf13Q9D777 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnfsf13Q9D777 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf13Q9D777 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf13Q9D777 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf13Q9D777 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf13Q9D777 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf13Q9D777 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf13Q9D777 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf13Q9D777 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf13Q9D777 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf13Q9D777 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf13Q9D777 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf13Q9D777 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf13Q9D777 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf13Q9D777 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfsf13Q9D777 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfsf13Q9D777 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfsf13Q9D777 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfsf13Q9D777 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfsf13Q9D777 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfsf13Q9D777 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfsf13Q9D777 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfsf13Q9D777 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfsf13Q9D777 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfsf13Q9D777 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfsf13Q9D777 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfsf13Q9D777 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfsf13Q9D777 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfsf13Q9D777 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfsf13Q9D777 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfsf13Q9D777 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfsf13Q9D777 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfsf13Q9D777 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfsf13Q9D777 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfsf13Q9D777 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfsf13Q9D777 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfsf13Q9D777 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfsf13Q9D777 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfsf13Q9D777 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfsf13Q9D777 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfsf13Q9D777 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfsf13Q9D777 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfsf13Q9D777 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfsf13Q9D777 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfsf13Q9D777 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfsf13Q9D777 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfsf13Q9D777 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfsf13Q9D777 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfsf13Q9D777 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms