Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms