Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Borcs6Q9D6W8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms