Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfn4Q9D6I3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfn4Q9D6I3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfn4Q9D6I3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfn4Q9D6I3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfn4Q9D6I3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms