Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W6

Slco6d1, MCG6225, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco6d1Q9D5W6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slco6d1Q9D5W6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slco6d1Q9D5W6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slco6d1Q9D5W6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slco6d1Q9D5W6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slco6d1Q9D5W6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slco6d1Q9D5W6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slco6d1Q9D5W6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slco6d1Q9D5W6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slco6d1Q9D5W6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slco6d1Q9D5W6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slco6d1Q9D5W6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slco6d1Q9D5W6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slco6d1Q9D5W6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slco6d1Q9D5W6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slco6d1Q9D5W6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slco6d1Q9D5W6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slco6d1Q9D5W6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slco6d1Q9D5W6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slco6d1Q9D5W6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slco6d1Q9D5W6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slco6d1Q9D5W6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slco6d1Q9D5W6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slco6d1Q9D5W6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Slco6d1Q9D5W6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slco6d1Q9D5W6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slco6d1Q9D5W6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slco6d1Q9D5W6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slco6d1Q9D5W6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slco6d1Q9D5W6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms