Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PudpQ9D5U5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms