Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5J6

Shpk, Sedoheptulokinase, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShpkQ9D5J6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ShpkQ9D5J6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms