Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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