Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam227bQ9D518 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms