Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D4W2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D4W2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D4W2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms