Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q4

4930578G10Rik, RIKEN cDNA 4930578G10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930578G10RikQ9D4Q4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930578G10RikQ9D4Q4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930578G10RikQ9D4Q4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930578G10RikQ9D4Q4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930578G10RikQ9D4Q4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930578G10RikQ9D4Q4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930578G10RikQ9D4Q4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930578G10RikQ9D4Q4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930578G10RikQ9D4Q4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930578G10RikQ9D4Q4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930578G10RikQ9D4Q4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930578G10RikQ9D4Q4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930578G10RikQ9D4Q4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930578G10RikQ9D4Q4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930578G10RikQ9D4Q4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930578G10RikQ9D4Q4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
4930578G10RikQ9D4Q4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
4930578G10RikQ9D4Q4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930578G10RikQ9D4Q4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms