Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lonrf3Q9D4H7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lonrf3Q9D4H7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms