Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W5

Lrrc71, Leucine-rich repeat-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc71Q9D3W5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrc71Q9D3W5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrc71Q9D3W5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrc71Q9D3W5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrc71Q9D3W5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrc71Q9D3W5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrc71Q9D3W5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrc71Q9D3W5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc71Q9D3W5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc71Q9D3W5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc71Q9D3W5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc71Q9D3W5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc71Q9D3W5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc71Q9D3W5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc71Q9D3W5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc71Q9D3W5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc71Q9D3W5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc71Q9D3W5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc71Q9D3W5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc71Q9D3W5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc71Q9D3W5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc71Q9D3W5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc71Q9D3W5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc71Q9D3W5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc71Q9D3W5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc71Q9D3W5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrc71Q9D3W5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrc71Q9D3W5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrc71Q9D3W5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrc71Q9D3W5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrc71Q9D3W5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrc71Q9D3W5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrc71Q9D3W5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrc71Q9D3W5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrc71Q9D3W5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrc71Q9D3W5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrc71Q9D3W5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrc71Q9D3W5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrc71Q9D3W5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lrrc71Q9D3W5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lrrc71Q9D3W5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lrrc71Q9D3W5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Lrrc71Q9D3W5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lrrc71Q9D3W5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lrrc71Q9D3W5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lrrc71Q9D3W5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrc71Q9D3W5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms