Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms