Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms