Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E4

Cysrt1, Cysteine-rich tail protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cysrt1Q9D1E4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cysrt1Q9D1E4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cysrt1Q9D1E4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cysrt1Q9D1E4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cysrt1Q9D1E4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cysrt1Q9D1E4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cysrt1Q9D1E4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cysrt1Q9D1E4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cysrt1Q9D1E4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cysrt1Q9D1E4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cysrt1Q9D1E4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cysrt1Q9D1E4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cysrt1Q9D1E4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cysrt1Q9D1E4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cysrt1Q9D1E4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cysrt1Q9D1E4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cysrt1Q9D1E4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cysrt1Q9D1E4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cysrt1Q9D1E4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cysrt1Q9D1E4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cysrt1Q9D1E4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cysrt1Q9D1E4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cysrt1Q9D1E4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cysrt1Q9D1E4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cysrt1Q9D1E4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cysrt1Q9D1E4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cysrt1Q9D1E4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cysrt1Q9D1E4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cysrt1Q9D1E4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cysrt1Q9D1E4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cysrt1Q9D1E4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cysrt1Q9D1E4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cysrt1Q9D1E4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms