Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms