Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms