Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Lsm12Q9D0R8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms