Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
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