Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ49

Klhl35, Kelch-like protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl35Q9CZ49 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl35Q9CZ49 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl35Q9CZ49 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl35Q9CZ49 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl35Q9CZ49 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl35Q9CZ49 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl35Q9CZ49 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl35Q9CZ49 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl35Q9CZ49 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl35Q9CZ49 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl35Q9CZ49 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl35Q9CZ49 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl35Q9CZ49 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl35Q9CZ49 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms